ओज़ोन (O3) एक कम आणविक भार अणु है जो त्रिकोणीय व्यवस्था में व्यवस्थित तीन ऑक्सीजन परमाणुओं से बना होता है। इसकी उच्च रासायनिक प्रतिक्रियाशीलता इसके अस्थिर इलेक्ट्रॉन विन्यास के परिणामस्वरूप होती है जो अन्य अणुओं से इलेक्ट्रॉनों की तलाश करती है। अन्य अणुओं के साथ इसकी प्रतिक्रिया के दौरान ओजोन नष्ट हो जाता है और कार्बनिक पदार्थ का ऑक्सीकरण हो जाता है। अन्य कीटाणुनाशकों की तुलना में, ओजोन प्रतिक्रियाओं के उप-उत्पाद पारिस्थितिक रूप से सौम्य हैं। चूंकि ओजोन तेजी से आणविक ऑक्सीजन में परिवर्तित हो जाता है - लगभग 20 मिनट के आधे जीवन के साथ - अंतिम उत्पाद में कीटाणुशोधन अवशेषों के बारे में चिंता करने की कोई आवश्यकता नहीं है। यद्यपि ओजोन को 19 वीं शताब्दी के मध्य में “खोजा” गया था, लेकिन पिछले कई दशकों के दौरान ही इसके कई अनुप्रयोग और लाभ स्पष्ट हो गए हैं। ओजोन का उपयोग इसके ऑक्सीडेटिव गुणों के लिए जल उपचार में किया जाता है। क्लोरीन की तुलना में 52 प्रतिशत अधिक ऑक्सीकरण शक्ति के साथ, ओजोन कार्बनिक और अकार्बनिक दोनों पदार्थों का ऑक्सीकरण करेगा; अवांछित स्वाद, गंध और रंग को हटा देगा; और प्रभावी कीटाणुशोधन प्रदान करेगा। ओजोन एक जीवाणुनाशक, कवकनाशी और विषाणुनाशक के रूप में बेहद कुशल है, जिससे क्लोरीन प्रतिरोधी क्रिप्टोस्पोरिडियम भी नष्ट हो जाता है। इसका उपयोग लोहे और मैंगनीज के ऑक्सीकरण और हटाने के लिए भी किया जा सकता है।