एक विच्छेदन माइक्रोस्कोप को अक्सर स्टीरियो माइक्रोस्कोप कहा जाता है, या कभी-कभी इसे स्टीरियोस्कोप कहा जाता है। उनका नाम जानवरों के नमूनों को विच्छेदित करने के लिए एक विज्ञान प्रयोगशाला में उनके विशिष्ट उपयोग से उत्पन्न होता है। हालांकि, उनके अधिकांश वास्तविक अनुप्रयोग विच्छेदन से बिल्कुल अलग चीज़ के लिए हैं। इसके अलावा, जानवरों को काटने के लिए कक्षा के वातावरण में विच्छेदन माइक्रोस्कोप का उपयोग करने के अलावा, उपकरण का उपयोग सिक्का और स्टाम्प इकट्ठा करने, छोटे निर्मित घटकों का निरीक्षण करने, फील्ड ट्रिप से प्रकृति की वस्तुओं को देखने, सर्किट बोर्ड की मरम्मत, सेलफोन की मरम्मत, रत्न ग्रेडिंग और कीटविज्ञान क्षेत्र में कीड़ों की पहचान जैसे अनुप्रयोगों के लिए किया जा सकता है। इनका उपयोग वनस्पति नमूनों की पहचान के लिए भी किया जा सकता है।